現在のPSO2では、課金アイテムの多くをマイショップで売買出来るため、ゲーム内マネー（メセタ）の重要度が最近のMMOの中では高い方で、さらには強化アイテムなど装備にかかわる部分も結局マイショップで取引できるため、マイショップありきのゲーム性となっています。

なのでひたすらマイショップを使い金銭をやりくりする転売行為や、複数アカウントで期間限定アイテムや特典アイテムを量産しようとする複アカ問題、さらに悪質なメセタを直接現金で購入しようとするRMTerなど、過去に何度も問題が起こっていました。
得にRMTに関するアカウントBANは現在でも毎月数十～数百と続いています。

結果インフレを招き、何でもかんでも高騰し始めたりとPSO2内の経済に悪影響を与えていることは間違いないです。それだけではなくスクラッチを回すユーザーが減ることでPSO2の運営状況にも影響が出てきます。

ショップ増税やトレード不可の理由を考察

NGSではこの教訓を生かし

• マイショップを利用して簡単にメセタを稼げないようにする
• システム（運営側）がメセタを回収出来るようにする
• トレード不可によってRMTを防ぐ
• 同時に複数アカウントプレイも無力化できる

この辺の枠組みを確かなものにして、経済の長期の安定を図りたいんじゃないかと思います。

おそらくNGS仕様のマイショップでは、取引できるアイテムも現PSO2以上に制限が入ると予想出来ます。FF14をはじめ、国産MMORPGの多くはアバターアイテムはほとんど取引出来ず、装備も大部分は取引不可で、ゲーム内通貨で出来ることはたかが知れています。
NGSもそれに倣い、素材やOPアイテムは取引不能で、時間を掛ければ誰でも大金を得られる素材売りなども封印されているかもしれません。

しかしPSO2はACスクラッチ（ガチャ課金）が課金要素の大部分です。
スクラッチで出たACアイテムがショップに出品できるのか、出品できないのかはまだ予想がつきませんが

1･マイショップで購入時にオーナー登録がついて再出品が不可能になる
2･購入する側も何かしら課金チケットのような物が必要になる
3･一切出品出来ない。が、回数ボーナスやリサイクルアイテムが凄く充実し、ゴミが出ても無駄にならない
4･出品額に上限が付く

このような制限がつく可能性もあります。

1の購入時オーナー登録は、これが一番簡単で販売者、購入者どちらも損は無く、なおかつ転売もシャットアウトできるので実装される可能性は高いです。

2の「購入する側も何かしら課金チケットのような物が必要になる」はいわゆるガチャアイテム購入権で、ゲーム内通貨とは別に必要（多くは有料）になります。
シンプルながら集金できる課金システムなので、ACアイテムが既に山ほど実装されているPSOでも導入されてもおかしくはありません。